Desde 1930 el edificio es museo municipal y en 1975 fue declarado Monumento Histórico Nacional. Lleva el nombre del pintor nacional Juan Manuel Blanes, al cumplirse en esa fecha los cien años de su nacimiento.

El museo tiene dos plantas. La planta baja cuenta con seis espacios de exposición: sala Juan Manuel Blanes, sala Pedro Figari, sala Dumas Oroño, dos salas/galerías y una sala de exposiciones temporarias. En la planta subsuelo se encuentran los depósitos donde está la colección del museo.